这种新方法不同于以前的任何方法,因为他们不仅检测人体组织的DNA变化,同时还检测HPV病毒的DNA,这种病毒可以通过性传播,最终导致各种疾病。这项研究近日发表在《肿瘤预防研究》杂志上,文章作者认为他们这种检测基因标记物的新方法灵敏度更高,在鉴定所谓的CIN2损伤测试中准确率高达90.9%,CIN2损伤指不仅可能发展成为癌症,同时还可能发展成为高度转移性癌症的异常细胞导致的宫颈损伤。此外,他们还强调检测所需的人体基因及病毒基因的DNA都可以从尿液中提取出来,他们可以通过这些DNA鉴定出病人是否携带这种损伤,灵敏度高达75%。而去年夏天欧洲批准使用的两项通过宫颈组织涂片检测DNA甲基化的商业测试灵敏度仅为64%。
“如果进一步研究验证了这些发现,那么尿检将是一项快速廉价而又准确的确定是否必要进行活检的新手段。”论文资深作者Rafael Guerrero-Preston解释道,他是约翰霍普金斯医学院的头颈癌手术医生兼副教授,“宫颈组织涂片异常的HPV阳性女性通常会进行活检以确定是否患有宫颈癌,但是研究表明50%的活检不仅没有必要,反而会导致疼痛、忧虑、不育以及高医疗费用。”
这项研究在他们前期研究基础上发展而来,他们曾发现是有三个基因与宫颈癌及可能癌变的异常细胞相关:FKBP6、INTS1、ZNF516,随着突变的发展,这三个基因DNA的特定位点会发生甲基化。Rafael Guerrero-Preston认为他们的新方法可以作为一种补充组织涂片检测的分子诊断手段,尤其是在贫穷、医疗基础设施或者文化信仰不允许患者进行组织涂片检查的发展中国家,他们的手段尤为重要。
首先,他们检测了214份接受组织涂片检测的妇女宫颈组织样品的DNA,以确定这三个基因是否可以作为癌变标记物。这些病人年龄在18-86岁之间,有34个病人无宫颈异常,87个病人这三个基因中至少有一个突变,90个病人显示明显的宫颈癌特征。接着他们从宫颈组织中分离出了DNA进行基因测序以确定DNA甲基化水平。他们发现如果以甲基化水平作为癌变诊断,这三个基因的灵敏度为90%(意味着一旦病人存在这样的甲基化,他们为宫颈癌患者的几率为90%),特异性为88.9%(意味着88.9%的情况下这种检测可以正确检测出病人有无宫颈癌)。为了提高准确性,他们又添加了HPV16-L1病毒基因作为癌变标记物,这个基因甲基化也与宫颈癌有关。他们又以这四个基因为标记物对另一批共计115个患者进行了宫颈组织检测,结果显示灵敏度高达90.9%,特异性为60.9%。
“在开发这项新技术的时候,我们期望它的灵敏度能有90-95%,这样才能与欧洲市场使用的检测手段竞争。”Guerrero-Preston解释道。
接下来他们对患者进行了血检和尿检,尝试直接提取循环DNA进行检测,对40个样品的检测发现通过血液DNA检测宫颈癌的灵敏度为85.7%,特异性为60.9%,而尿检的灵敏度和特特异性分别为75%、83.3%,同时整个过程所需时间很短,研究中从组织活检到完成血检、尿检只需要4天,他们下一步的计划是优化这种方法将尿检灵敏度提高到组织涂片检测的水平。
根据世界癌症基金研究会的报告,84%的宫颈癌发生在欠发达国家,非洲、拉丁美洲及加勒比海地区发病率最高,而在美国,宫颈癌也曾是造成女性癌症死亡的最大死因,但是40年前组织涂片检测的普及使这一情况得到了逆转,但没有基础医学设施或者文化不允许进行组织涂片检测的国家宫颈癌发病率及死亡率一直居高不下。
为了减短检测需要的时间,Guerrero-Preston及其同事已经和Cepheid公司达成协议,共同开发这种检测手段,他们计划使用Cephied的设备将目前实验室检测需要的4天时间降低到3个小时以内。
参考文献
来源:转化医学网