斯坦福大学遗传学系,药理学系的几位学者合作,开发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术—— CRISPR-X,这将能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。
目前通过定向进化法分析蛋白功能,进行蛋白质工程研究受限于整体诱变,或DNA文库构建方面的技术问题。这篇文章针对于此,研发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术:CRISPR-X。
研究人员催化激活休眠的 dCas9,令其召集携带MS2修饰sgRNAs的胞嘧啶脱氨酶(cytidine deaminase,AID)突变,从而能特异化诱变内源靶标(限制脱靶伤害)。这样就能生成多个不同的点突变文库,同时靶向多个基因组位点。
为了验证这种方法,研究人员诱变了GFP,筛选了光谱转移突变,比如EGFP,而且他们还突变了癌症治疗药物万珂(Bortezomib)的靶标——PSMB5,Bortezomib是目前批准上市的唯一治疗恶性肿瘤的蛋白酶体抑制剂,能特异性抑制哺乳动物细胞内26S蛋白酶体的类胰凝乳蛋白酶。
结果他们从中找到了引发Bortezomib耐药性的已知和全新的突变。同时研究人员还利用超活化AID突变,诱变了其转录起始位点上游和下游的位点。
这些研究均表明 CRISPR-X 是一种强大的工具,能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。
来源:生物通 作者:张迪