2016杭州云栖大会在云栖小镇召开,已经连续举办了两届的基因计算专场因其大众而又前沿的属性,引发了大量关注和讨论。2016年云栖大会基因计算专场在第二天举行,会议主题为“解读生命的力量-Interpret the power of life”。
基因,承载生命之密。计算,解读基因之美。生命体如此复杂,需要人类用海量的计算资源来解读生命的奥秘。基因与计算握手,硅基与碳基融合,基因计算专场探讨了基因科学中的计算力量!华大基因大数据总监金鑫、WeGene创始人陈钢、安诺优达云平台架构师王振飞、中科晶云科技云平台产品总监卜德超、阿里云生命云产品经理林河山、英特尔精准医疗与生命科学创新业务总监李健带来基因计算方面的精彩分享。
金鑫-进化:构建基因产业的基础设施
华大基因大数据总监金鑫,介绍了基因技术发展、基因测序普及、基因编辑时代即将到来的今天,云计算构建基因产业的基础设施的必要性。并分享了华大如何通测序硬件设备、BGI On Line计算平台和国家基因库大数据,来实现基因产业基础设施的搭建,并对未来的基因测序行业的存储和计算问题等进行了展望,期望通过基因产业基础设施的构建来实现生命之树的解码。
陈钢-服务:数据驱动的基因组分析和解读
微基因创始人陈钢介绍了如何在公共云计算基础设施上实现面向公众的基因组分析和解读服务。分享了通过个人基因组和日常生活中的表型数据的收集,在其公司研发的微基因平台上,可构建对个人基因组的微解读、研究,实现对个人健康的自我量化和持续监控。陈钢博士最后对未来基因计算领域所涉及的一系列问题进行了展望。
王振飞-上云:基因存储计算的必然选择
安诺优达的云平台架构师王振飞详细介绍其安诺云所实现的生物信息分析流程的一键式解决方案。在基因大数据不断爆炸的今天,基因存储和计算上云是必然选择。针对目前NGS数据所面临的存储、计算、安全、维护问题,安诺云在阿里云计算平台的基础上,构建其多种生物信息流程,可一站式的解决其中的计算问题。
卜德超-抗击:大数据分析助力遗传病肿瘤精准医疗
这是基因计算专场中唯一涉及到了基因大数据临床应用的报告。中科晶云的云平台产品总监卜德超介绍了其团队已搭建完成的两个面向临床应用的平台。“晶云TM-单基因遗传病解读平台”,“准、易”地解决了遗传病二代测序数据分析中的“算点”和“选点”两个关键问题,可很好辅助遗传病的临床诊断。“晶锐TM-肿瘤NGS数据分析解读一体机”,可直连测序仪进行部署,精准地鉴定变异,并给出药物推荐,非常适用于医院和临检所搭建其内部专用的肿瘤伴随诊断计算平台。
林河山-展望:生命云的新发展和规划
阿里云生命云产品经理林河山介绍了基因数据的发展,其实是从量变到质变的一个转变过程,伴随着这个转变需求云计算的支持,并能最终展现出云计算的价值; 并详细介绍了阿里云对于目前生命云的存储、计算等的支撑性技术产品,包括已经推出的对象存储OSS、归档存储、BatchCompute, Maxcompute,E-Mapreduce, 即将推出的OSS-IA,文件存储NAS等; 针对目前生命云的现状,详细地分享了阿里云对基因行业的思考,以及在支撑行业需求上的动作。
李健-计算:精准医疗必需的变革力量和创新阵地
英特尔精准医疗与生命科学创新业务总监 、英特尔精准医疗伙伴计划负责人李健用了全球视野介绍精准医疗时代,计算对精准医疗的重要性。介绍了精准医疗的变革时代及其计算主战场的分析,并分享了英特尔精准医疗计算创新解决方案,提出了24小时精准医疗的未来愿景。
来源:测序中国
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