牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)透露,正在开发一种连接智能手机使用的纳米孔传感器,用于DNA测序和其他应用中。公司还对其他研发中的新产品进行了介绍。另外,该公司成立了一家分公司,名为Genome Foundry,关注合成生物学的应用。
开发连接智能手机使用的纳米孔仪器SmidgIon
公司首席技术官Clive Brown透露,这款新型纳米孔仪器称作SmidgIon,正处于早期研发阶段,预计在2017年末可以投入使用。该产品同样将使用应用于MinIon和PromethIon仪器的核心纳米孔传感技术,但是该仪器将比MinIon更小,每个flow cell中有256个channel,可以连接到智能手机上或者其他低功率仪器上,用于感应DNA、RNA或蛋白质。
据公司透露,SmidgIon可应用于更加广泛的领域,包括疾病爆发中的病原体监测,分析环境样本或者农业样本,对于野生动植物或木材进行实时物种鉴定。
其他正在开发中的产品
Brown说,另一个处于早期研发阶段的产品称作Project Zumbador,该产品将生物学样本的核酸提取和文库制备结合到一个设备中,将在第三季度发布。
公司同时还在研发MinIon和PromethIon上直接进行RNA测序的kits,这项产品计划在接下来的几个月内提供给开发者。公司表示,该产品可利用adapter和马达蛋白控制RNA移位,指导RNA进入纳米孔。Oxford使用这种方法已经对来自人类鼻病毒的RNA进行了测序,并表示直接进行RNA测序可以检测到RNA上的甲基化修饰。
另外一个产品VolTrax是一款样本制备仪器,将在今年秋天提前供应给目前使用Oxford纳米孔测序平台的客户。公司表示,首批发布的仪器VolTrax将依附在一个小型USB仪器上,然后附着于MioIon或者PromethIon仪器上。
Oxford Nanopore同样还计划不久后实现MinKonw平台碱基识别软件的本地使用。
第一台PromethIon近期已经出货
Brown说,第一台PromethIon近期已经出货给客户了,他还展示了该平台的一些内部数据,共使用了48个flow cell,每个flow cell中含有3000个channel。使用R9试剂,每个纳米孔每秒测序250个碱基,准确率和小孔利用率都与MinIon一致。该系统目前的性能是运行48小时产生6.2Tb数据,将来会进一步增加至12.4Tb。根据Brown的报告,公司目前正在调试软件用于控制大型数据集的碱基实时识别,优化芯片表面化学试剂以及生产流程,并开发一种快速的碱基识别程序。
全部使用新型纳米孔R9
除此之外,Brown表示,Oxford Nanopore已经不再出售R7纳米孔的flow cell,现在已经全部替换成R9纳米孔的flow cell,R9即CsgG,最近得到比利时VIB研究所和伦敦大学学院授权。Brown补充道,新型的flow cell还整合了坚固的膜和一个更新的解旋酶马达蛋白。公司使用新的flow cell测序得到的最长读长为500kb,目前主要关注于提升通量和同聚物识别能力。
公司在一份声明中指出,R9系统具有更高的准确率,尤其是对于1D reads,这种reads仅读取DNA的一条链。新型碱基识别软件不同于以往的隐马尔可夫模型,它是基于神经网络模型,进一步提升了准确率。R9型flowcell测序时,每个纳米孔每秒测序250个碱基,而R7型每秒最多测定70个碱基,因此公司表示换用R9型flow cell后MinIon将产出更多的数据。Brown说,目前1D reads的准确率为90%,2Dreads准确率为95%。
与R9型flow cell配套,公司正在推出一种快速测序kit。用该kit建库只需要10分钟,而且使用的耗材比以前更少,MinIon运行开始后马上进行数据分析。公司声明中表示,目前许多早期客户正在测试这款快速测序kit,“它将很快推出市场。”
成立分公司Genome Foundry
Brown最后提到了Oxford Nanopore的一家新的分公司Genome Foundry,该公司旨在开发一种“用于合成生物学的MinIon”,使用专有的、非亚磷酰胺的DNA合成试剂。公司的目的是为了使用类似于VolTrax的仪器开发长链DNA分子。
来源:测序中国 作者:iseqer
为你推荐

带状疱疹疫苗“遇冷”,百克生物2024年净利润腰斩
近日,国内疫苗龙头企业百克生物发布2024年年报,数据显示,其报告期内实现营收12 29亿元,同比下降32 64%;归属于上市公司股东的净利润2 32亿元,同比下降53 67%。对于营收...
2025-04-23 12:59

重庆常用药联盟接续集采中选结果
近日,重庆常用药联盟接续集采中选情况公布,该联盟由重庆牵头,联合湖北、广西、海南、贵州、云南、青海、宁夏、新疆及新疆生产建设兵团等十省(区、市)开展的药品集中带量采...
2025-04-21 18:48

全周期智控慢病,诺和诺德与京东健康开启战略合作
2025年4月21日,全球领先的生物制药公司诺和诺德与京东健康在北京正式签署战略合作协议,标志着双方在糖尿病和体重管理领域的合作进入新阶段。依托诺和诺德百年深耕慢病领域的专...
2025-04-21 15:57

康方生物1类新药依若奇单抗上市申请获批,用于中重度斑块状银屑病成人患者
该药是我国第一个且唯一获批上市的IL-12 IL-23“双靶向”单克隆抗体新药,是康方生物自身免疫性疾病领域首个获批上市的一类新药。
2025-04-21 13:39

阿斯利康乳腺癌1类创新药卡匹色替片中国获批
该药适用于联合氟维司群用于转移性阶段至少接受过一种内分泌治疗后疾病进展,或在辅助治疗期间或完成辅助治疗后12个月内复发的激素受体(HR)阳性、人表皮生长因子受体2(HER2)...
2025-04-21 11:02

辉瑞宣布终止一款口服GLP-1减肥药的临床开发
近日,辉瑞在其官网宣布,决定终止开发口服胰高血糖素样肽-1受体(GLP-1R)激动剂Danuglipron(PF-06882961),原因系在一项有关用药剂量的临床试验中,一名患者出现了可能由该...
2025-04-21 10:29

福建省医保局印发单列门诊统筹支付医保药品目录(2024年版)
根据2024年6月发布的《福建省医保药品单列门诊统筹支付管理办法(试行)》,为了让参保患者无需住院、在门诊就医也能用上国家谈判药品、享受医保待遇,将适用于门诊治疗、使用周...
2025-04-20 13:34

首批中国消费名品名单,医药健康企业有哪些?
近日,工业和信息化部办公厅发布首批中国消费名品名单,分为中国消费名品名单和中国消费名品成长企业名单。首批中国消费名品名单共包括93个企业品牌和43个区域品牌。中国消费名...
2025-04-20 11:17

携手共绘“个性化近视手术”新蓝图:爱尔眼科与爱尔康启动100家医院全光塑技术战略合作
双方将以技术共享为核心,以人才培养为支撑,以科研协作为纽带,全力推进屈光手术标准化诊疗体系建设,加速前沿技术在临床领域的普及应用
文/ 屈慧莹 2025-04-19 23:35

CDE:简化港澳已上市传统口服中成药内地上市注册审批申报资料及技术要求
允许香港、澳门特区本地登记的生产企业持有,并经香港、澳门特区药品监督管理部门批准上市且在香港、澳门特区使用15年以上,生产过程符合药品生产质量管理规范(GMP)要求的传统...
2025-04-18 18:54

君德医药完成近亿元A轮融资,加速推进创新药械组合平台建设与产品上市
本轮融资主要用于首个减重口服器械的注册及生产销售,以及加速多个核心创新药械组合技术平台的产品管线研发进程。
2025-04-18 14:34

礼来首个小分子口服GLP-1RA药物orforglipron 3期临床研究成功
Orforglipron是首个成功完成3期临床研究的小分子GLP-1类药物,各剂量组平均A1C降幅为1 3%至1 6%
2025-04-18 14:12