金域检验首席科学家于世辉:基因诊断在肿瘤临床使用时有哪些需要注意的问题

医疗健康 来源:测序中国 作者:iseqer
2016
05/12
18:02
测序中国
作者:iseqer
医疗健康

基因检测技术被称为实验诊断领域的革命,随着高通量测序、全基因组芯片扫描等基因检测手段的大范围普及,技术的进步推动了医疗模式的巨大改变,基因检测这个全新的诊断技术领域,在疾病诊断、预后、风险评估以及治疗效果监测等方面的作用越来越重要。

金域检验作为国内大型的第三方医学检验机构,在香港和大陆共设立了31家实验室,其中金域临床基因组检测中心更以肿瘤个体化医疗、遗传性疾病诊断、优生优育临床诊断服务为核心。

近日,记者带着“如何做好分子诊断?如何做到健康惠民?”等问题,采访了美国医学会医学遗传学学会注册临床遗传学家,金域检验首席科学家兼临床基因组检测中心医学总监于世辉博士。

于博士,您好!您在基因诊断的研究和应用方面拥有丰富的经验。请您介绍一下,当前基因诊断在肿瘤临床使用时有哪些需要注意的问题?

于世辉:最近,我感受到当谈到基因诊断时,有人会误以为就是在谈基因测序。我们常用到的核型分析、荧光原位杂交技术(FISH)、包括现在热门的NGS都是基因诊断的常用技术。我认为需要多种技术结合使用,才能得到精准的检测结果。即使是新技术的出现,也不会成为万能的手段。比如说,在世界卫生组织已出版的白血病、淋巴瘤(诊断)指南中,明确地指出任何一种类型的白血病和淋巴瘤,其基因检测都不能采用单一的技术。NGS的出现确实为基因、基因组检测提供了一个新途径,在发现新的位点突变方面提供了大量的信息,具有重要的临床有意义。虽然如此重要,但也无法代替其他的检测技术。金域作为负责的医疗机构,在实施检测时,会根据不同疾病的具体情况,设计不同的检测方案。在达到最高的检出率的同时,让病人的花费降到最低。在这里我要强调,第三方检验机构在进行检测服务时,一定要考虑到病人的承受能力,以及医生解释结果的能力,把握好两者间的平衡点。

现在,各方火热探讨的精准医疗,其中一个做得较为成功的方面就是肿瘤的精准治疗——靶向药物治疗。什么是靶向药物治疗?就是建立在基因突变基础之上的精准药物治疗。自从靶向药物伊马替尼(imatinib)应用以来,到现在越来越多的靶向药物被研发出来,并投入临床上使用。所以精准药物的治疗还会持续下去,但对于疾病而言,除了药物的精准治疗,还应重视精准的诊断以及预后的判断。

NGS作为较晚出现的检测技术,您能否介绍一下该技术在哪些领域已有成熟应用?未来的应用前景如何?

于世辉:实际上,NGS在肿瘤、遗传性疾病领域里都有不错的应用,相对而言在遗传性疾病诊治上更成熟一点。目前对肿瘤病人实施基因测序的目的主要是做靶向药物治疗。对遗传性疾病的诊断而言,通过全外显子组测序甚至是全基因组测序,有大量新致病的遗传基因被发现,以前无法判断病因的一些遗传性疾病能被盖棺定论。以全外显子测序为例,在核型分析正常、染色体正常的基础之上,其检出率可高达到25%到28%。这在十年前几乎是不可想象的。所以在遗传性疾病的诊断上,NGS带来了革命性突破。

基于NGS技术的无创产前检测(NIPT),从卢煜明教授在90年代发现以来,经过十几年的探索、发展以及应用,现已获得政府、医院的认可,成为产前检测的一项重要手段。但NIPT目前主要用于13,18,21染色体的三倍体检查,也在探索应用于几种比较常见的微缺失综合征检测。虽然国外也有几家公司正在开展这类检测工作,但是美国妇产科指导性建议书里并不推荐用NIPT的方法对微缺失综合征进行检测。进一步说,人类的遗传性疾病,不仅涉及染色体数量以及结构的异常,还有8000多种单基因病。已开始有科学家在考虑,NIPT除了检测染色体的数量与结构以外,是否还能同时检测到所有的单基因病的致病位点。从现有技术角度而言,通过母亲外周血只能获得胎儿一小部分DNA,含量很少,因此无法达到可靠的检测准确度检出所有的单基因病。尽管理论上是可行的,想要实现胎儿的单基因病筛查,还面临着技术层面、伦理层面、以及我们对疾病本身的认识等诸多问题。那么从技术成型到应用到临床,还有一条很长的路要走。

金域检验成为首批基因检测示范中心,您能否分享一下此次获批的经验呢?

于世辉:现在,国家正逐渐在政策上给企业松绑,鼓励相关企业、事业单位以及高等院校开展基因检测技术,为病人服务。而我们在国内相关标准出台之前,以欧美的规范来严格要求自己,在科研水平上希望能做到先行一步。当国家政策一出台,我们能够成为行业标准的先行者,同时又能帮助大家做好相关工作。现在,金域已拥有成熟的技术、完善的平台、巨大的服务网络以及从各个层次上懂得遗传基因组检测规范,了解世界发展方向的领导团队。因此,已万事俱备。当机会来临时,我们要做的是去把握好这个机会。

获批示范中心是对我们多年来工作的认可。我们将继续按照国家的法律法规和行业标准,一步一步地走下去。当前我们和全国很多高校进行合作,做好科研技术的储备。已制定的企业短期、中期和长期的整体发展规划保持不变。

金域作为大型的第三方医学检验机构,如何将基因检测做到惠及于民?

于世辉:我认为将基因检测做到更精准,更“价廉物美”,才能惠及于民。我国的新生儿筛查目前主要使用质谱等技术,美国NIH大约在两年前就在探讨如何使用下一代基因测序技术(NGS)进行新生儿筛查。美国有家名为Parabase Senomics的公司,已经把NGS应用到新生儿筛查,该公司筛查的544个基因准确率达到100%。

美国在若干年前就开始在临床上应用全外显子组测序。记得我在西雅图儿童医院工作时,经常和其他分析人员聚在一起对测序报告进行解读。虽然花费了大量的时间和人力,但是解读工作依旧困难,能得到有效结果仍旧困难。有太多的基因突变被检测出来,我们目前却还无法了解这些突变的临床意义。人类基因组中包含有两万多个编码基因,其中只能解释5000多个基因与疾病的关系。在两年前的ACMG大会上,国外科学家首先提出了医学外显子组的概念,即针对已知的5000多个基因测序并给出解释。这种做法不但降低了检测的成本,并且更具目的性,在短期内医学外显子的检测应该更适合于临床对遗传性疾病的诊断。这些数据的积累,将会为未来采用基因组测序技术对新生儿进行遗传性疾病筛查奠定基础。

来源:测序中国   作者:iseqer

(原标题:金域检验首席科学家于世辉:积累医学外显子组数据,将基因检测做到“价廉物美”)

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