首届基因组云计算技术开发者大会上,阿里云、华大基因、BGI都说什么了?

医疗健康 来源:基因慧PPT微信号:genemeet 作者:汪亮
2016
04/14
15:46
基因慧PPT微信号:genemeet
作者:汪亮
医疗健康

引言:接着上篇基因组云大会第一天会议纪要,以及和演讲者本人沟通修正,更新21家单位26位演讲者PPT精华。笔者有幸见证了这共享共建的时间,同时欣喜看到WeGene,奇云诺德等平台的国际化产品思维,即将出台的第一部基因行业的标准,以及首次亮相的BGI基因编辑和合成生物平台等。

概览:

1) 标准化研究院等政策标准制定

2)红杉资本等资本方对精准医疗的态度

3)奇云诺德,WeGene等国内基因云平台

4)阿里,百度,华为等云基础架构

5)罗湖医院作为终端用户的探索和期待

6)BGI基因编辑平台,合成生物平台等

1、政策标准相关单位

1) 梅永红,深圳国家基因库主任华大基因农业集团董事长兼总裁

2) 高健,中国电子技术标准化研究院

3) 尹烨,华大股份有限公司执行总裁

这里将提到政策的优先级,第一步基因组行业标准的出台

2、市场资本

红杉资本,同创伟业,金翼资本,蓝色彩虹谈对精准医疗的投资态度及前景预测。

这里将把精准医疗和传统医疗,互联网作为对比,明确提出“精准医疗是一个风口”,“IT+BT”是一个爆发点

3、基因组云平台介绍

1) 金鑫,华大股份研发大数据中心总监

2) 罗奇斌,奇云诺德CEO

3) 陈钢, WeGene联合创始人

4) 李厦戎,GeneDock创始人&CEO

5) 余乐,基云惠康联合创始人&CTO

这里将提到首个百万基因组的有趣和首创解读,国内云平台与23andme的对接,以及如何吸引境外数据上传分析;可以看到如何通过云“发送”APP,实现技术的产品化等

4、云基础架构介绍

这里阿里云,百度开放云,华为云,英特尔,SAP,天河超算等“华山论剑”,不仅从计算,存储,分析,传输,安全等方面解决痛点,同时对顶层设计,精准医疗在医疗价值体系的本质作用做了深入思考。虽然尚需完善,能看到基础设施对精准医疗的热情和决心

5、用户单位的需求和示例

这里罗湖医院集团吴松副院长谈了作为三级医院,探索分级诊疗和精准医疗的新模式,结合远程诊断中心和基因资源,并交流了精准医疗的需求。此外高健主任(中科院微生物研究所网络信息中心)通过展示中国主导的全球微生物数据资源库,体现了当今数据资源云管理的理念和强大。

6、BGI基因编辑平台和合成生物平台

这里BGI的基因编辑平台负责人王健博士展示了在基因编辑方面的计划以及在精准医疗和农业的应用,合成生物平台沈玥博士介绍了合成生物目前发展的阶段,已经可以采用动物,植物,细菌,酵母等不同物种的部分基因合成青蒿素,吗*啡等,同时展示了BGI合成生物业务的方向和应用

结语

云平台是基因组以及推而广之生命科学大数据的必然载体,它从系统上解决技术,应用,拓展,安全等问题,云平台是趋势。

云平台也是复杂的,集成了BT,IT,产品设计,临床研究,生命伦理等多领域,并非把几个应用连接起来在网络上运行就是云。它需要跨学科融合,交流,开放和顶层设计。

我们欣喜看到,不同行业的大家持有的开放的心态,虽然这是开端,但它越来越开放,共享共建共见是不可阻挡。这是共享经济的时代,这是最好的时代,因为有你我的舞台。

以下为4月11日会议第一天的听会纪要。共享共见。亮点如下:

#1 第一个人类遗传资源的法规和标准

#2 分析生物大数据的需求和挑战

#3 资本对精准医疗行业的态度

#4 百度开放云首度公布三大产品体系

#5 WeGene的泛娱乐个人基因组

#6 中国的第一个百万基因组的有趣解读

注:听会纪要未经过演讲者审核,仅供学习参考用。


1

BGIonline平台负责人金鑫介绍大会的主要安排,由下页Slide可看出高屋建瓴的顶层设计,这是当前行业急需的资源整合,尤其在BT+IT两个大产业的交叉学科和产业区域认知盲点。


2

国家基因库的“梅叔”提出了很重要的一句话,精准医疗体系,产品和法规尚不完善,但都在加速推进。结合后来资本平台谈到,精准医疗的风口的发展,比早期互联网的发展的条件要便利很多。


3

中国电子技术标准化研究院感知技术研究所的高健老师提出了要对《中国人类遗传资源条例》的重视,以及目前正在代表国标委和BGI合作建立的第一个基因组数据标准。


4

微生物所网络信息中心马俊才主任和大家展示了全球微生物数据中心,显示出来中国的微生物数据管理的实力和在国际上的影响力。目前已实现对菌株数据生命周期的全方位记录,包括自身信息,使用信息,在数据库中的查询检索信息等。


5

BGI的尹总慷慨激昂地和我们分享了生物大数据的意义,以及从计算,存储,传输等角度阐述了需求和挑战,后续各云平台架构服务商遥相呼应分别对此做出解决方案。


6

在圆桌论坛环节,我们看到了BGI从投资行业引进的职业经理人张凌,引领其他几位资本大咖谈对精准医疗的看法。总体来看,资本对精准医疗的前景(市场,创业,上市)比较乐观,同时当下显示出没有对医药的及时热情。小编认为这和技术实现,用户认知和市场接受度有关。资本是最理性的。



7

阿里云,华为云,百度开放云分别基于各自已有的架构设计,讲述了三个雷同的故事,提出如何提高计算,存储,传输,安全等问题。有决心和热情参与精准医疗市场,同时小编就曾在2012年的BGI参与第一版云平台开发以及后来和临床大夫接触的经历来看,目前的云平台基础架构,依然没有直达用户痛点,没有完全坦诚的面对,分析并个性化解决当下应用场景中的问题。尚需努力!

8

聚道的李厦戎用非常专业漂亮的PPT,从基因数据流的角度,展示了聚道的解决方案描述,强调了数据的流动性的意义。

WeGene的陈钢用非常娱乐的口吻,认真讲述了消费级的个人基因组的应用场景,除了祖源,运动之外,还包括计算任何两人的亲缘关系,基因产品的社交功能。同时恭喜WeGene赢来国际化的时期——一周增加400份国外人基因数据,并且支持23andme数据,国外分析平台支持WeGene数据,以及国际网站的开放。

9

BGI的金鑫展示了全球第一个真正意义上的百万基因组,以及对这些大数据的解读结果,可以看出很多是开创性的工作,以及数据背后蕴含的巨大价值。

大家可能对SAP不熟悉,但对他提供的ERP系统服务一定不陌生。覃璞先生提到价值医疗体系公式,用量化的关系理清了医疗体系中各因素的关系,以及精准医疗扮演的角色(适用度),以及在其中SAP对改善临床观察,即有效整合表型数据所起的作用。

小结

现在是北京时间2016/4/12 03:43

身处麒麟山庄,背靠青山,隐约真有一点修道论剑之气。

修——健康所系,造福百姓和自我之道,论——大数据时代,如何落地应用之剑术。

是的,这不是空话。

无论基础架构,应用平台,临床落地,资本或者技术,政府或者民间,都离不开事情初心,即,创造健康生活,创造市场,客户,以及你我都可以受益的基因时代个性化健康管理。如果明确这一点,技术的着力点,资本的周期性投放,都有一个方向。

来源:基因慧PPT微信号:genemeet   作者:汪亮

(原标题:独家: 首届基因组云大会PPT精华(阿里云,红杉资本,BGI等21家全产业链))

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