由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现,采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术,可以揭示出两者转录谱的改变。
在发表于《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,这一研究小组描绘了他们的技术,为什么这一技术对于更多地了解细菌感染机制非常有用,以及在研究中获得重要发现。
Eunice Kennedy Shriver国家儿童健康与人类发育研究所的Matthias Machner和Gisela Storz,在同一期的Nature杂志上发表了一篇“新闻与观点”(News and Views)文章介绍这项研究工作。
Machner和Stortz指出,以往大多数的研究想更好地了解细菌感染宿主时发生的事件,都是将焦点放在细菌或是宿主的信使RNA上。在这项新研究中,研究人员采用了一种技术使得能够同时聚焦两者,从而能够获得感染初期阶段和后期阶段发生事件更完整的图像。
这一称作为双RNA测序(dual RNA-seq)的方法,使得研究人员能够同时研究宿主转录物和病原体信使RNAs——在这里,他们研究的对象是感染一种人类细胞系的沙门氏菌。更特别地是,他们将焦点放在了一种叫做PinT的小RNA上,众所周知在细菌开始感染宿主细胞时PinT会激活。更细致的观察揭示出它还调控了肠道沙门氏菌的一些基因,并有一些迹象表明它影响了宿主转录模式,转而导致了一些长链非编码RNAs发生改变及激活了宿主细胞中其他一些信号通路。
研究人员解释说,这种双RNA测序方法对细菌进行了绿色荧光标记,使得在宿主细胞受到感染时能够鉴别出细胞的一些部位。这一技术允许随着感染病程的发展研究来自两种生物的信使RNA和非编码RNAs转录物,以前所未有的角度观测了这一过程。这一研究小组还记录了他们的研究阐明感染过程中的小变化如何传遍整个宿主系统,导致了感染宿主不同结局的过程。
转录组是特定细胞或组织在特定时间或状态下转录出来的所有RNA的集合。通过对转录组的研究可以揭示生物体的基因表达,研究结构变异及发现新基因。RNA测序作为一种新的转录组研究手段,利用新一代测序技术能够更快速、准确地为人们提供更多的生物体转录信息。近年来,这一方法在生物科学和医学研究中非常流行,并正在逐渐走向临床应用。
前不久,中科院上海生科院神经所的张旭研究员在十二月二十二日的Cell Research杂志上发表了新成果。他领导研究团队根据单细胞RNA测序和功能异质性鉴定了躯体感觉神经元的类型。
由约翰霍普金斯大小华人科学家宋红军领导一个科学家小组报告称,他们结合单细胞RNA测序和自身开发出的生物信息学流程Waterfall,揭示出了成体神经发生的分子级联反应。这项重要的研究发布在2015年8月20日的《细胞干细胞》(Cell Stem Cell)杂志上。
来自同济大学医学院、加州大学洛杉矶分校、南昌大学等处的研究人员报告称,他们利用单细胞RNA测序技术,同时运用加权基因共表达网络分析(WGCNA),揭示出了激活休眠神经干细胞的信号。这一重要的研究结果发布在2015年的5月21日的《细胞》(Cell)杂志上。
来源:生物通 作者:何嫱
为你推荐

悦唯医疗完成近亿元A++轮投资,加速重症冠心病诊疗全流程创新器械研发与国产替代
此次融资将主要用于深化冠心病诊疗全流程创新器械和脉动式左心室辅助系统等新产品的研发,以及加速已获准上市的心脏稳定器等产品的市场推广。
2025-04-03 09:28

海尔盈康一生启动孤独症儿童关爱行动,创新罕见病可持续公益新生态
本次活动聚焦孤独症儿童的诊疗,探讨交流AI赋能全流程防治康体系创新、前沿性生物科技诊疗技术等话题,旨在通过生态联盟的力量推动医学研究、科技创新与人文关怀的融合,让“星...
2025-04-03 09:11

《NPJ digital medicine》刊发李冬梅教授团队成果:AI赋能高效识别眼睑肿物
亚太眼整形外科学会主席、中华医学会眼科分会眼整形眼眶病学组副组长李冬梅教授团队携手爱尔数字眼科研究所,在《NPJ digital medicine》(影响因子:12 4)学术期刊发表团队...
文/李林 2025-04-02 10:27

默克全球执行副总裁周虹:合作与创新是默克未来五年战略的两大关键词
近日,德国默克医药健康全球执行副总裁、中国及国际市场负责人周虹带领医药健康中国及国际市场管理团队开启了2025年度首次“中国行”。
2025-04-01 17:11

首个且唯一,阿斯利康PD-L1单抗获FDA批准治疗肌层浸润性膀胱癌
度伐利尤单抗联合吉西他滨和顺铂作为新辅助治疗,随后度伐利尤单抗作为根治性膀胱切除术后的辅助单药治疗,用于治疗肌层浸润性膀胱癌成年患者。
2025-04-01 14:37

全国首个,湖北为脑机接口医疗服务定价
昨日(3月31日),据“湖北发布”消息,湖北省医保局发布全国首个脑机接口医疗服务价格,其中,侵入式脑机接口置入费6552元 次,侵入式脑机接口取出费3139元 次,非侵入式脑机...
2025-04-01 11:03

一款国产创新流感药,获批
近日,据国家药监局官网信息显示,青峰医药下属子公司江西科睿药自主研发的1类创新药玛舒拉沙韦片(商品名:伊速达)正式获批上市,用于既往健康的12岁及以上青少年和成人单纯性...
2025-04-01 10:22

26省联盟药品集采启动,聚焦妇科用药和造影剂
近日,山西省药械集中招标采购中心发布《关于做好二十六省联盟药品集中带量采购品种数据填报工作的通知》,开展相关采购数据填报工作。
2025-03-31 21:48

优时比罗泽利昔珠单抗注射液(优迪革)中国获批,全球首个且唯一双亚型创新药治疗全身型重症肌无力
作为唯一人源化、高亲和力且具备创新修饰结构的IgG4单抗,关键Ⅲ期MycarinG试验证实罗泽利昔珠单抗注射液(优迪革®)较安慰剂显著改善全身型重症肌无力患者的多个临床终点与结局。
2025-03-31 15:58

从手术麻醉到生命全周期护航,麻醉学科发展拓宽生命边界
3月26日,由中华医学会麻醉学分会、中国医师协会麻醉学医师分会等23家学协会共同举办的2025年中国麻醉周学术活动的启动仪式举办,该活动以“生命之重,大医精诚——守生命保驾护...
2025-03-31 15:30

欧狄沃联合逸沃成为中国目前唯一获批的肝细胞癌一线双免疫联合疗法
欧狄沃联合逸沃对比仑伐替尼或索拉非尼,可显著改善不可切除肝细胞癌一线患者的总生存期(OS),客观缓解率(ORR)可改善近3倍,中位缓解持续时间(mDOR)达30个月
2025-03-31 13:45

罗氏制药榜首 “现金牛” 产品罗可适(奥瑞利珠单抗)在华获批:开启多发性硬化症一年两次治疗新时代
罗氏制药今日(3月31日)宣布,其旗下创新药罗可适®(Ocrevus®,通用名:奥瑞利珠单抗注射液 ocrelizumab injection)正式获得中国国家药品监督管理局批准,每六个月静脉输...
2025-03-31 13:39

三生有幸,医者仁心:三生制药向全体医药工作者致敬!
3月30日是国际医师节,由三生制药公益支持的以“三生有幸,医者仁心”为主题的公益活动,携手20位医生代表,以寄语海报的形式,共同向全体医护人员表达诚挚的祝福与关爱。
2025-03-30 17:38